了解如何转化生物与健康研究人类健康产生的“大数据”改善了知识。

作为一个主要的生物信息学,你会采取在计算机科学,计算生物学,数学,统计学和化学课程。潜入研究和基于项目的课程旁边你的教授,并作为一个大学生目前专业级的研究。

采取野生盆地创意研究中心的优势,奥斯汀自然保护区由圣管理。爱德华的,在哪里进行了生物信息学对学生的研究 - 例如 - 原生植物的真菌微生物组。并连接与奥斯汀的不断增长的生物技术产业,公司正在利用生物信息学凡制定解决方案,在农业以及基因测试和个性化医疗的问题。

什么我们的毕业生呢?

生物信息学专业的学生去上各种从ST事业和研究生院。爱德华。这里是一个什么样我们的应届毕业生正在做样品。

  • 在CDK全球和戴尔EMC工作
  • 加州大学戴维斯分校完成计算机科学研究生课程为一体的综合计算昆虫学奖学金接受者
  • 完成硕士在生物信息学ST程序。圣路易斯大学生物信息学,国家科学基金会奖学金按位收件人
  • 研究生在波士顿大学,圣路易斯大学,佛罗里达中央大学和德克萨斯大学达拉斯分校

发现的快感

发现的快感

在ST本科生研究。爱德华与专业导师连接学生,鼓励他们接受新的挑战并找到了一些职业帮助他们万万没有想到的。 LEA acerca 五名学生,主要的包括生物信息学,他的研究寻找答案。  

学位要求

主要要求: BS在七十二小时内生物信息学需要专业课程,包括计算机科学,计算生物学,数学/统计和化学的组合。

选修课: 11至12小时的学生完整所需选修从生物学,COSC,化学,和数学(至少05.06 3000+)

普通教育要求: 56小时的教育课程,一般需要超过四年,除了主要的课程和选修课程。

查看并下载完整 重大生物信息学学位计划(PDF).

课程的学生的几个例子采取重大ESTA:             

  • 在生物数学建模 - 介绍了常微分方程及其应用生物学。主题包括一阶微分方程,一阶系统,线性系统,非线性系统,迫使和共振,数值方法,和动力系统,如许可证的时间。生物建模和生物学研究文章中的例子将被纳入整个课程。
  • 生物信息学 - 对计算的发展和应用焦点问题途径提出和回答的生物学问题。材料将从特定绘制,包括相关的生物序列分析,基因组测序和装配,生物模式识别,DNA微阵列数据的分析,以及生物网络生物的问题。
  • 生物编程  - 在生物研究方面教,这门课程向学生介绍的原则和工具来处理和分析必要的生物数据。其重点是
    数据采集​​和分析,计算内容包括在基因组和蛋白质组,生态数据分析和生物系统的数学模型的研究中使用的技术五月。

我们的教师和学生支持服务

我根据我的大家都学习如何通过引人注目的问题的背景和需要到了解的基础上的新信息的理解传授。我发现这种方法建立ESTA我的学生的学习兴趣,动机和来源众多学习新材料的能力。它也是我的功能有助于学生过渡到成功的职业生涯,以及在研究中继续读研究生。

查尔斯·豪瑟,生物信息学副教授

学生支持服务

随着个人的关注和指导从他们的教授,学生有机会获得我们的办公室,并计划在课堂之外,他们的成功支持。我们鼓励学生充分利用这些资源,帮助他们茁壮成长和Excel:

  • 学术咨询和建议
  • 补充说明和辅导
  • 事业编制,并建议 
  • 写作中心咨询
  • 健康和健康咨询
  • 残疾学生支持

 

 

了解更多有关这些服务.

教室外

学生在生物信息学专业可以探索职业道路,并通过他们的研究和互动有了更大的奥斯汀社区研究的实际应用。

研究

杰奎琳Turcinovic '18和博士。查尔斯·豪瑟考察八个本土野生植物在盆地的创意研究中心的根部微生物组相关的真菌群落的组成(裂稃花棒,xalapensis杨梅,reverchonii乱子草属,lindheimeriana nolina,腺牧豆树,rupicola丝兰,刺柏兔眼蓝莓和苔草planostachys)。结果,以endosphere日期馏分指明八个厂五个出现子囊菌富集; ESTA富集不限于单子叶植物或真双子叶植物。鉴定在根(endosphere)真菌是真菌区分发现克利从“外部植物”真菌种群根(根围)识别潜在的因此是“内的植物”之外。 [1]虽然这些结果是初步的,他们这样做支持,植物正在招募特别是真菌系统,他们的根系统的假设,以表面上是促进关键此类营养物质,如磷和氮的植物吸收,促进植物生长,以及来自中介的保护和灵敏度的病原体。 

凯莱博士托马森和'18。查尔斯·豪瑟工作与在Knipling丛林美国科学家畜牧业昆虫研究实验室在德克萨斯州克尔维尔采用生物信息学的方法是确定潜在的疫苗针对的目标南部的牛从各种组装剔 镰形扇头microplus 序列。进行了预测潜在的肽和蜱相比于人类,果蝇和牛蛋白质组,以独特的识别蜱蛋白质。这些蛋白质将作为目标在疫苗的发展可能打击的重新崛起 镰形扇头microplus 在美国养牛业。

Chelsey wildenborg '17进行的项目调查潜在毒性细胞的纳米粒子暴露由于单细胞绿藻使用生物莱茵衣藻模型。 Chelsey训练机使用从RNA测序的控制数据和经处理细胞,并使用随机森林方法能够成功地分类未知样品学习算法(mlseq)。

出版物和会议 

  • 38日的总。爱德华的学生都在基础上,研制完成的基因组学和基因组学的一部分发表的两篇论文的合着者由教授查尔斯·豪瑟在合作教授拥有博士课程研究探索。莎拉·埃尔金和基因组学教育联盟(GEP)。杂志上发表的两篇论文分别为G3:基因|基因组学|遗传学。

科学德州学院

  • 杰奎琳turcinovich '18被授予她的作品“最佳墙报奖”,“关于在菜豆灵敏度,菜豆湖磷真菌微生物的作用”年,2016年
  • 乔·迪伦苏打被授予了最佳海报奖,他的作品标题,C的细菌和真菌的微生物组根“分析。 planostachys(莎草科)“。 2015年。

年度会议的生物医学研究少数民族学生(abrcms)

  • 伊莱亚娜杰奎琳Turcinovic,最好口头陈述被授予了她的工作,“在野生盆地真菌微生物组的网络和社区的分析”(2015年) 

奥斯汀的科学和技术现场访问 

  • 索萨乔·迪伦和isavanna国王领导的协会计算生物学,组织了一趟当地生物信息公司,Asuragen公司(SP17)。博士。杰西卡·拉尔森一些科学家和生物信息学研究,满足学生们讨论了与他们的职业路径,职业发展机会,并提供设施的参观。迪伦的评论是,“这是为了更多地了解这个行业的生物信息学两侧以及对当地的生物技术公司的真棒机会。”

实习

已生在著名的研究经验争夺本科生(雷乌斯)的机会成功,沉浸学生正在进行的研究项目。最近我们的学生,都应该进行了研究:

  • 杰奎琳Turcinovic '18,BRITE欧洲区域办事处,波士顿大学
  • 詹姆斯·斯图尔特'17,夏季植物基因组学研究项目,密歇根州立大学
  • 玛丽亚·卡德纳斯'16,生物医学科学研究生院,智能准备程序,贝勒医学院学院
  • isavanna王'17,卓越的HHMI研究机会计划 
  • 迪伦苏打'17,基因组学研究:本科奖学金计划,基因组研究所,美国圣路易斯华盛顿大学。路易

研究和实地体验课程

生物信息学的简历是在基于项目的学习中心,例子包括:

  • 自2005年以来,学生就读于基因组学从事博士举办了全国本科基础研究项目(治愈)。莎拉·埃尔金和基因组学教育合作(GEP)。 ESTA已导致2协作随着38日科学出版物。爱德华的学生共同作者。  
  • 生物信息学是一个基于项目的过程中,他们的学生申请编程技能(Python)的各种生物的问题,设定,如:序列比对,隐马尔可夫模型,系统发生谱和RNA-Seq的分析。  
  • 医生之间的合作。迈克尔卡丁(CS)和DR。豪瑟(BINF)得到的一对哪位同学分离,测序和在奥斯汀地区采集的土壤样品国情的噬菌体团队讲授的课程。这对由HHMI举办的课程是 - 科学教育联盟(SEA),并在2个噬菌体基因组公布结果。 

培训和实习

校外有偿专门培训机会

作为生物信息学学生程序,你是对筹资方案提供接入以阻止在ST独家提供的学生。bet36体育在线的研究所交叉科学(12-14)。 I4目前提供的学费奖励高达$ 2,000的专门培训和小额资格认证随着I4使命相一致的。此外,I4提供支付,在工作场所实习使学生获得宝贵的实践经验,因为他们前进学术和专业。有关访问这些程序请详细信息 研究所交叉科学(12-14) 在网上。